Пептидната връзка е ковалентна връзка, която се установява между две молекули, когато карбоксилната група на едната реагира с аминогрупата на другата чрез реакция на кондензация (или дехидратация, което води - тоест - до елиминиране на водна молекула) .
Обикновено пептидната връзка се образува между две аминокиселини, което води до дипептид.
Тъй като дипептидът в неговата молекула все още включва амино и карбокси група, той може да образува пептидна връзка с трета аминокиселина, давайки трипептид и т.н. Когато броят на аминокиселините е относително малък, той се нарича олигопептид, докато ако броят на аминокиселините се увеличава, той се нарича полипептид или протеин.
В действителност, въпреки фигурата, пептидната връзка не е от простия тип, а има 60% характер на единична връзка и 40% двойна връзка.
В живите организми образуването на пептидната връзка се катализира от ензим - наречен пептидил трансфераза - присъстващ в основната субединица на рибозомите.
Протеините, въведени в диетата, също са изградени от аминокиселинни вериги, свързани чрез пептидни връзки. По време на храносмилането тези връзки се разрушават от определени ензими (пептидази), присъстващи в стомашния сок и сока на панкреаса. Единичните аминокиселини, веднъж усвоени от червата, преминават от кръвта и се улавят от клетките - особено от черния дроб - които ги обединяват чрез нови пептидни връзки, за да образуват нужните им протеини (не само структурни, но и хормонални, ензимни и т.н. Всъщност в природата има голям брой протеини, с различни физико -химични характеристики, които произтичат от различните свойства на 20 -те обикновени аминокиселини и от това как те се комбинират в полипептидната верига. Просто помислете, че протеин от 100 аминокиселини, следователно относително малък, той може да се състои от 20100 = 1,27 x 10130 възможни полипептидни вериги.Инструкциите за изграждане на правилната аминокиселинна верига се съдържат в генома на индивида.